|
|
Registro completo
|
Biblioteca (s) : |
INIA Las Brujas. |
Fecha : |
13/03/2020 |
Actualizado : |
13/03/2020 |
Tipo de producción científica : |
Artículos en Revistas Indexadas Internacionales |
Autor : |
BRANDA, A.; NICOLINI, P.; FEDERICI, M.; LLAMBÍ, S. |
Afiliación : |
ANDREA BRANDA SICA, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; PAULA NICOLINI, Universidad de La República, Centro Universitario de Tacuarembó, Instituto Superior de la Carne, Área Biología Molecular; MARIA TERESA FEDERICI RODRIGUEZ, INIA (Instituto Nacional de Investigación Agropecuaria), Uruguay; SILVIA LLAMBÍ, Universidad de La República. Facultad de Veterinaria, Sección Genética. |
Título : |
Identification of Holstein cows carriers of complex vertebral malformation by high resolution melting curves (HRM). [Identificação de vacas holandesas portadoras da malformação vertebral complexa através de curvas de dissociação de alta resolução - HRM.] |
Fecha de publicación : |
2019 |
Fuente / Imprenta : |
Archives of Veterinary Science. 2019, Vol.24, Issue 4, p. 62-70. DOI: 10.5380/avs.v24i4.65494 |
ISSN : |
1517-784X |
DOI : |
10.5380/avs.v24i4.65494 |
Idioma : |
Inglés |
Notas : |
Article history: Recebido em 18 Março 2019 / Aprovado em 28 Agosto 2019.
Corresponding author: Andrea Branda - email: abranda@inia.org.uy |
Contenido : |
ABSTRACT.
The objective of this study was the optimization and implementation of a reliable and economical molecular screening method for the detection of the mutant allele of CVM (complex vertebral malformation, c.559G>T, SLC35A3) by HRM analysis, as well as analyzing its existence in a representative sample of Holstein cows from the Milk Genomic DNA Bank of Uruguay. The optimization of the HRM methodology in the RotorGene? 6000 equipment (Corbett Life Science, Australia) by amplification of the 79 bp PCR products clearly differentiated the two genotypes: homozygous, wild type: GG; and heterozygous, carrier for the mutation CVM: GT (c.559G>T; SLC35A3). In the analyzed sample, the frequency of the mutant allele (T) for CVM was high (q= 0.032), with a prevalence of carrier cows of 6.45%. It is concluded that the PCR-HRM analysis is a fast, easily interpretable, low cost, and highly accurate technique for the detection of this mutation in Holstein cattle, which may be implemented in genetic selection programs.
RESUMO.
O objetivo deste estudo foi otimizar e implementar um sistema fiável e econômico para a detecção molecular do alelo mutante CVM (malformação vertebral complexa; c.559G>T; SLC35A3) por meio da análise HRM, assim como analisar sua presença em uma amostrarepresentativa devacas Holandesasdo Banco de ADN do Instituto Nacional de Pesquisa Agropecuária de Uruguai. A otimização da metodologia HRM no equipamento RotorGene?6000 (Corbett Life Science, Austrália) através da amplificação dos produtos de PCR de 79 pb permitiu diferenciar os dois genótipos: ohomozigoto de tipo salvagem (GG) e o heterozigoto que presenta a mutação CVM (GT). Verificou-se que a frequência do alelo mutante (T) para CVM na amostra analisada foi alta, de q= 0,032, enquanto que a prevalência de vacas portadoras da mutação foi 6,45%. Concluiu-se que a análise por PCR-HRM é uma técnica rápida, facilmente interpretável, de baixo custo e alta precisão para a detecção dessa mutação no gado Holandês, que poderia ser implementada em programas de seleção genética. MenosABSTRACT.
The objective of this study was the optimization and implementation of a reliable and economical molecular screening method for the detection of the mutant allele of CVM (complex vertebral malformation, c.559G>T, SLC35A3) by HRM analysis, as well as analyzing its existence in a representative sample of Holstein cows from the Milk Genomic DNA Bank of Uruguay. The optimization of the HRM methodology in the RotorGene? 6000 equipment (Corbett Life Science, Australia) by amplification of the 79 bp PCR products clearly differentiated the two genotypes: homozygous, wild type: GG; and heterozygous, carrier for the mutation CVM: GT (c.559G>T; SLC35A3). In the analyzed sample, the frequency of the mutant allele (T) for CVM was high (q= 0.032), with a prevalence of carrier cows of 6.45%. It is concluded that the PCR-HRM analysis is a fast, easily interpretable, low cost, and highly accurate technique for the detection of this mutation in Holstein cattle, which may be implemented in genetic selection programs.
RESUMO.
O objetivo deste estudo foi otimizar e implementar um sistema fiável e econômico para a detecção molecular do alelo mutante CVM (malformação vertebral complexa; c.559G>T; SLC35A3) por meio da análise HRM, assim como analisar sua presença em uma amostrarepresentativa devacas Holandesasdo Banco de ADN do Instituto Nacional de Pesquisa Agr... Presentar Todo |
Palabras claves : |
Curvas de dissociaçãode alta resolução; CVM; High-resolution dissociation curve. |
Asunto categoría : |
L10 Genética y mejoramiento animal |
URL : |
http://www.ainfo.inia.uy/digital/bitstream/item/14303/1/Branda-A.-2019.-Archives-of-Veterinary-Science.pdf
https://revistas.ufpr.br/veterinary/article/download/65494/40219
|
Marc : |
LEADER 03306naa a2200229 a 4500 001 1060918 005 2020-03-13 008 2019 bl uuuu u00u1 u #d 022 $a1517-784X 024 7 $a10.5380/avs.v24i4.65494$2DOI 100 1 $aBRANDA, A. 245 $aIdentification of Holstein cows carriers of complex vertebral malformation by high resolution melting curves (HRM). [Identificação de vacas holandesas portadoras da malformação vertebral complexa através de curvas de dissociação de alta resolução - HRM.]$h[electronic resource] 260 $c2019 500 $aArticle history: Recebido em 18 Março 2019 / Aprovado em 28 Agosto 2019. Corresponding author: Andrea Branda - email: abranda@inia.org.uy 520 $aABSTRACT. The objective of this study was the optimization and implementation of a reliable and economical molecular screening method for the detection of the mutant allele of CVM (complex vertebral malformation, c.559G>T, SLC35A3) by HRM analysis, as well as analyzing its existence in a representative sample of Holstein cows from the Milk Genomic DNA Bank of Uruguay. The optimization of the HRM methodology in the RotorGene? 6000 equipment (Corbett Life Science, Australia) by amplification of the 79 bp PCR products clearly differentiated the two genotypes: homozygous, wild type: GG; and heterozygous, carrier for the mutation CVM: GT (c.559G>T; SLC35A3). In the analyzed sample, the frequency of the mutant allele (T) for CVM was high (q= 0.032), with a prevalence of carrier cows of 6.45%. It is concluded that the PCR-HRM analysis is a fast, easily interpretable, low cost, and highly accurate technique for the detection of this mutation in Holstein cattle, which may be implemented in genetic selection programs. RESUMO. O objetivo deste estudo foi otimizar e implementar um sistema fiável e econômico para a detecção molecular do alelo mutante CVM (malformação vertebral complexa; c.559G>T; SLC35A3) por meio da análise HRM, assim como analisar sua presença em uma amostrarepresentativa devacas Holandesasdo Banco de ADN do Instituto Nacional de Pesquisa Agropecuária de Uruguai. A otimização da metodologia HRM no equipamento RotorGene?6000 (Corbett Life Science, Austrália) através da amplificação dos produtos de PCR de 79 pb permitiu diferenciar os dois genótipos: ohomozigoto de tipo salvagem (GG) e o heterozigoto que presenta a mutação CVM (GT). Verificou-se que a frequência do alelo mutante (T) para CVM na amostra analisada foi alta, de q= 0,032, enquanto que a prevalência de vacas portadoras da mutação foi 6,45%. Concluiu-se que a análise por PCR-HRM é uma técnica rápida, facilmente interpretável, de baixo custo e alta precisão para a detecção dessa mutação no gado Holandês, que poderia ser implementada em programas de seleção genética. 653 $aCurvas de dissociaçãode alta resolução 653 $aCVM 653 $aHigh-resolution dissociation curve 700 1 $aNICOLINI, P. 700 1 $aFEDERICI, M. 700 1 $aLLAMBÍ, S. 773 $tArchives of Veterinary Science. 2019, Vol.24, Issue 4, p. 62-70. DOI: 10.5380/avs.v24i4.65494
Descargar
Esconder MarcPresentar Marc Completo |
Registro original : |
INIA Las Brujas (LB) |
|
Biblioteca
|
Identificación
|
Origen
|
Tipo / Formato
|
Clasificación
|
Cutter
|
Registro
|
Volumen
|
Estado
|
Volver
|
|
Registro completo
|
Biblioteca (s) : |
INIA La Estanzuela. |
Fecha actual : |
21/02/2014 |
Actualizado : |
22/02/2014 |
Autor : |
Alvarez, C. ; Cayssials, R. ; Molfino, J.H. |
Título : |
Estimación del almacenaje de agua en las tierras de Uruguay |
Fecha de publicación : |
1990 |
Fuente / Imprenta : |
ln: Seminario Nacional de Campo Natural, 2 : 1990 nov 15-16 : Tacuarembó Montevideo (Uruguay): Hemisferio Sur, 1990. |
Páginas : |
p63-76 |
Idioma : |
Español |
Notas : |
Participaron en el seminario : INIA, Sociedad Uruguaya de Pasturas Naturales, Facultad de Agronomía, Plan Agropecuario |
Thesagro : |
ALMACENAMIENTO DE AGUA; CARTOGRAFIA; CLASIFICACION DE SUELOS; CONTENIDO DE AGUA EN EL SUELO; PASTIZAL NATURAL; RETENCION DE AGUA POR EL SUELO; TIPOS DE SUELOS; URUGUAY. |
Asunto categoría : |
-- |
Marc : |
LEADER 00890naa a2200253 a 4500 001 1048438 005 2014-02-22 008 1990 bl uuuu u00u1 u #d 100 1 $aALVAREZ, C. 245 $aEstimación del almacenaje de agua en las tierras de Uruguay 260 $c1990 300 $ap63-76 500 $aParticiparon en el seminario : INIA, Sociedad Uruguaya de Pasturas Naturales, Facultad de Agronomía, Plan Agropecuario 650 $aALMACENAMIENTO DE AGUA 650 $aCARTOGRAFIA 650 $aCLASIFICACION DE SUELOS 650 $aCONTENIDO DE AGUA EN EL SUELO 650 $aPASTIZAL NATURAL 650 $aRETENCION DE AGUA POR EL SUELO 650 $aTIPOS DE SUELOS 650 $aURUGUAY 700 1 $aCAYSSIALS, R. 700 1 $aMOLFINO, J.H. 773 $tln: Seminario Nacional de Campo Natural, 2 : 1990 nov 15-16 : Tacuarembó Montevideo (Uruguay): Hemisferio Sur, 1990.
Descargar
Esconder MarcPresentar Marc Completo |
Registro original : |
INIA La Estanzuela (LE) |
|
Biblioteca
|
Identificación
|
Origen
|
Tipo / Formato
|
Clasificación
|
Cutter
|
Registro
|
Volumen
|
Estado
|
Volver
|
Expresión de búsqueda válido. Check! |
|
|